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重磅!剑桥大学发现不同地区新冠病毒存在显著差异

常熟理工李杰 生命科学前沿 2021-03-18

一场突如其来的疫情打乱了人们原本的生活节奏,目前COVID-19已成为全球大流行。而自疫情发生以来,关于“病毒从哪里来”的追问就没有停止过。

     最近,剑桥大学研究人员发表在《美国科学院院刊》(PNAS)上一篇针对新冠病毒溯源的研究发现,虽然新冠病毒目前的基因突变并不明显,但根据这些有限的基因突变仍可以将其分成A、B、C三种类型,并且新冠病毒的这三种类型在全球分布范围明显不同。     研究人员通过绘制2019年12月至今年3月新冠病毒的基因发展史,发现了上述三种不同但又密切相关的病毒类型。然后通过在全球范围内收集的160份感染样本研究了不同类型的新冠病毒在全球传播的轨迹

      研究人员以蝙蝠冠状病毒RaTG13作为外类群,用于指示所构建网络的根部。三种类型中,A类离根部最近,B类次之,C类最远,换句话说,从时间先后来看,A类是最早出现的病毒,B类随后出现,C类最后出现。      有意思的是A类又可以细分为两个子类分别为时间更早的T等位基因子类和稍晚的C等位基因子类。主要是通过病毒N基因上的一个同义突变来区分的,这个突变发生在病毒基因组上第29095个碱基上,因为不造成编码氨基酸的改变,所以称为同义突变。突变前和突变后的碱基分别是T和C。其中T子类离根部更近一些,即发生时间应该更早一些。     T等位基因子类中包括四个中国人(来自广东省)、三个日本人和两个美国人。特别注意,要画重点“这两个美国人有武汉居住史”!!C等位基因子类包括五个武汉人、八个东亚地区的(来自中国非武汉地区和其他邻近国家)以及15个主要来自美国和澳大利亚等。重点


根据文中的数据可知:病毒最早源头为 T等位基因子类,即广东人、日本人和2个在武汉待过的美国人结合另外一个早先报道的论文,武汉目前最早溯源的新冠病毒Wuhan-Hu-1毒株其实是比T等位基因子类稍晚的C等位基因子类。所以上述结果是不是这样的:最早病毒株来源于广东人、日本人和在武汉待过的美国人。然而武汉实际测得最早的病毒种类只有C等位基因子类,比这2个在武汉待过的美国人所属的病毒还要晚??这。。。。。。但这里又有广东人和日本人什么事呢?论文的数据着实奇怪。可能需要未来更多的大数据解读才能还所有事情一个真相!

参考文献

https://www.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.2004999117


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